NVIDIA вступили в борьбу с вирусом COVID-19

Компания NVIDIA решила внести свой вклад в исследование коронавируса. Она предлагает воспользоваться своими инструментами, которые помогут понять природу COVID-19. А конкретно, NVIDIA бесплатно предоставляет 90-дневную лицензию на Parabricks всем исследователям нового коронавируса. Платформа  Parabricks основана на наборе инструментов Genome Analysis и работает на базе GPU, ускоряя анализ данных в секвенциях до 50 раз. NVIDIA также сообщила, что будет готова продлевать доступ по мере необходимости.  Учитывая беспрецедентную скорость развития пандемии, быстрое получение результатов может помочь быстрее понять эволюцию вируса, чтобы быстрее создать эффективные вакцины.

 Для исследователей, работающих с секвенированием с длительным считыванием Oxford Nanopore, на GitHub доступен репозитарий инструментов, ускоряемых на GPU. Ускорение на графических процессорах NVIDIA также поддерживают такие приложения, как Medaka, Racon, Raven, Reticulatus, Unicycler. В настоящий момент исследователи секвенируют как геном коронавируса, так и геномы людей, заболевших COVID-19, чтобы понять, как распространяется болезнь и кого она затрагивает в первую очередь. Однако анализ последовательностей геномов занимает много времени и требует существенных вычислительных ресурсов.Ускорение научных исследований уже давно является одной из приоритетных задач NVIDIA. Команда Parabricks вошла в состав NVIDIA в декабре 2019, дополнив существующий инструментарий NVIDIA новейшими инструментами в области секвенирования генома. Инструменты Parabriks помогают сократить время определения вариантов генома человека от дней до часа всего на одном сервере.

NVIDIA приглашает партнеров присоединиться к помощи исследователям. В настоящий момент мы обсуждаем возможность предоставления вычислительных ресурсов и доступа к Parabricks на платформах провайдеров облачных сервисов и суперкомпьютерных центров. Если у вас есть доступ к графическим процессорам NVIDIA, заполните форму, чтобы получить лицензию на Parabricks.